Zusätzlich zum regulären Unterricht bietet die Freiherr-vom-Stein-Schule in den einzelnen Jahrgängen unterschiedliche Arbeitsgemeinschaften mit verschiedenen Themenschwerpunkten an.
Im Schuljahr 2024/25 werden beispielsweise folgende AGs angeboten:
- Turn-AG
- Karate-AG
- Ballsport-AG
- Chor-AG
- Mädchen-Ballsport-AG
- Schülerrat-AG
- Streitschlichter-AG
- Tischtennis-AG
- Werken-AG