Zusätzlich zum regulären Unterricht bietet die Freiherr-vom-Stein-Schule in den einzelnen Jahrgängen unterschiedliche Arbeitsgemeinschaften mit verschiedenen Themenschwerpunkten an.
Im Schuljahr 2025/26 werden beispielsweise folgende AGs angeboten:
- Turn-AG
- Chor-AG
- Naturfreunde-AG
- Musik-AG
- Yoga-AG
- Mädchen-Ballsport-AG
- Schülerrat-AG
- Streitschlichter-AG
- Tennis-AG
- Kreativ-AG
- Ipad-AG